研究小组开发通用且准确的方法来计算蛋白质如何与药物相互作用

来自捷克科学院有机化学和生物化学研究所/IOCB布拉格的一个研究小组开发了一种新颖的计算方法，可以准确描述蛋白质如何与潜在药物分子相互作用，并且可以在短短数十分钟内完成。因此，这种新的量子力学评分函数可以显着加快新药的寻找。该研究已发表在《自然通讯》杂志上。

该研究表明，这是同类方法中第一个普遍适用的方法。IOCB布拉格计算专家对10种不同结构复杂程度的蛋白质进行了测试，每种蛋白质都结合了多种小分子(通常称为配体)。然后，他们不仅将他们的结果与其他相应方法的结果进行了比较，而且还与实验室实验的结果进行了比较，两次比较的结果都非常好。

“当然，我们并不是唯一从事这方面工作的人。有几种这样的方法。然而，通常，它们的速度会被低精度所抵消，而更准确的计算可能需要几天的时间。我们的方法是独一无二的，因为它们可以处理信息PavelHobza教授领导的非共价相互作用小组的文章通讯作者JanŘezáč解释道：

该小组的专家长期以来一直在研究分子间相互作用。在这项研究中，他们主要关注生物分子，其工作成果直接影响药物的计算机辅助设计。原因是，当科学家研究新药时，他们经常寻找与特定蛋白质牢固结合的分子。

然而，识别它们就像大海捞针一样，因为必须测试大量分子才能区分出那些有希望的分子。这大大减慢了药物的发现速度并使其更加昂贵。通过预测蛋白质-配体结合的强度，从而选出最能满足一组定义标准的分子，计算化学家可以节省实验人员的工作，从而显着加速药物发现。