脊椎动物3D扫描项目向所有人开放收藏

将博物馆中的脊椎动物藏品数字化并使其免费在线供任何人访问的尝试已经达到了一个里程碑。该项目对约13,000个标本进行了3DCT扫描，代表鸟类、两栖动物、爬行动物、鱼类和哺乳动物的一半以上。

该项目名为oVert(openVertebrate)主题收集网络，刚刚完成了为期四年、价值250万美元的国家科学基金会拨款，迄今为止的努力已在《生物科学》杂志上发表的一篇论文中描述。

康奈尔脊椎动物博物馆是参与oVert的18个机构之一，已上传了大约500个藏品标本的CT扫描。博物馆藏有约130万件鱼类标本、27,000件爬行动物和两栖动物(统称为疱疹)、57,000件鸟类和23,000件哺乳动物标本。

“并不是每个人都有兴趣参观博物馆，因此通过将标本数字化，将所有内容放在网站上并免费提供，任何想要访问它的人都可以无需离开家，这允许更公平的访问，”康奈尔大学农业与生命科学学院脊椎动物博物馆鱼类和疱疹馆馆长、生物科学论文的合著者凯西·迪尔曼(CaseyDillman)说。

到目前为止，用户包括艺术家、高中生和大学生、教育工作者和科学家。

oVert允许以协作方式使用所展示的自然历史馆藏，例如在课堂上。这种格式使得比较不同物种的解剖结构变得更加简单。

“你可以做很多事情，”迪尔曼说。“你可以比较标本并观察四肢的进化，或者鸟类和蝙蝠的翅膀，或者鱼的鳃。”

该平台的一个限制是每个样本数据集的大小可能为2到3GB，要求用户能够使用配备昂贵图形处理器的计算机来可视化数据。“不是每个人的笔记本电脑都能做到这一点，”迪尔曼说。

该资助背后的想法是对每个脊椎动物属的一个物种进行CT扫描，从而建立一个在线数字图书馆，其中包含每种生物体的外观(其表型或可观察的特征)的骨骼解剖学。虽然大多数图像都是骨骼，但有些图像用特殊溶液染色，以提供更好的对比度并可视化软组织，例如皮肤和肌肉。扫描仪使用X射线，其强度可以设置为与软组织的医用X射线一样弱，也可以设置为足够强以透视岩石和化石。

每幅图像中包含的博物馆目录号链接到标本来源的机构数据库。数据库条目包括样本的采集时间、地点和人员。

迪尔曼说，从很多方面来说，oVert项目才刚刚开始。“一万三千个物种甚至还没有触及脊椎动物多样性的表面，”他说。

例如，仅鱼类就有36000多种;他说，每个属一个物种是一个良好的开始，但需要时间和额外的资金来体现多样性的巨大深度。

“如果你考虑一下北美的一些鱼类谱系，一个属内可能有200个物种，”他说。

每一轮的资金将使团队能够继续代表更多的属，并从每个属中添加更多的物种。

该资助的主要研究员是佛罗里达州盖恩斯维尔佛罗里达自然历史博物馆爬行动物学馆长大卫·布莱克本(DavidBlackburn)。