生物学家揭示关键碳水化合物附着机制如何发生故障
发布时间:2024-06-27 15:16:29 编辑:仇进莉 来源:
研究人员发现了身体碳水化合物(糖链或“聚糖”)中一种调节其与其他分子结合方式的结构如何与关键酶相互作用,从而导致一系列疾病。
人体最重要的生化过程之一涉及碳水化合物(糖链或“聚糖”)与蛋白质和脂肪(脂质)的结合,当这一过程发生故障时,患上一系列疾病的风险就会急剧增加。研究人员最近发现,在这种结合过程中,一种关键酶与聚糖中的一种小结构相互作用,可能导致这种分解。
他们的研究成果发表在《生物化学杂志》在线版上。在线版的一篇论文中。
在生物体内,碳水化合物或“聚糖”附着在蛋白质或脂质上的过程(称为“糖基化”)在大量生理过程中起着至关重要的作用。它是细胞识别、细胞信号传导、免疫反应、蛋白质折叠、发育和受精所必需的。同时,聚糖结构的轻微改变可能导致或加重癌症、糖尿病、阿尔茨海默氏症和肌营养不良症等疾病。
事实上,聚糖及其相关过程非常重要,因此有了自己的领域:糖生物学。在这个学科中,几乎所有负责人类聚糖生产的酶(启动或加速化学反应的分子)都已被识别和分类,以及各种生产过程或“生物合成途径”。
然而,尽管糖生物学作为一个领域已经成熟,研究人员和临床医生仍然需要能够更准确地预测和微调聚糖结构,从而更好地应对糖基化功能障碍可能导致的各种疾病。因此,研究人员仍然需要更好地了解将聚糖附着到蛋白质或脂质上的酶(“糖转移酶”)的活性在细胞内是如何调节的。
在两种类型的聚糖中,N 连接聚糖(与蛋白质内的氮原子连接的聚糖)和 O 连接聚糖(与蛋白质内的氧原子连接的聚糖),存在一种由两种糖组成的结构,称为 LacdiNAc,或简称为 LDN,位于聚糖的末端(末端位置)或半末端(次末端位置)。LDN 结构的生物合成由两种酶中的一种催化,即 B4GALNT3 或 B4GALNT4。在其他聚糖中,没有 LDN,而是略有不同的双糖结构,称为 LacNAc。
这种 LDN 结构已被证实参与一系列重要的身体过程,并且在许多疾病中其功能失调。特别是,体内循环的几种激素被 LDN 修饰,并且 LDN 似乎参与干细胞的维持。此外,催化 LDN 生物合成的 B4GALNT3 变体与骨密度降低和骨折风险增加有关,并且当 B4GALNT3 似乎被关闭时,结肠癌的风险会增加。
“鉴于所有这些与疾病和关键身体过程有关的确凿证据,我们必须了解这些酶如何合成 LDN,”本文首席研究员、岐阜大学糖核研究所 (iGCORE) 的糖生物学家 Yasuhiko Kizuka 说道。“但到目前为止,这些过程一直是个黑匣子。”
但近年来,结构生物学、酶学和糖组学的进展提供了新的工具和技术,为此类研究提供了可能性。
首先,通过对所有已知的人类糖基转移酶的结构进行筛选,研究人员发现,在两种类型的B4GALNT中,都有一个独特的特征,即在其他糖基转移酶中不常见的“PA14结构域”。
研究人员还将正常 B4GALNT3 的酶活性与他们突变的糖基转移酶版本进行了比较,突变后的版本缺乏 PA14 结构域,以了解当这种结构缺失时会发生什么。然后,他们将正常 B4GALNT3 的活性与其他正常糖基转移酶和聚糖修饰酶进行了比较。
此外,论文作者还制作了 B4GALNT3 及其 PA14 结构域的计算机模型,以研究影响酶活性的潜在结合相互作用和结构特征。他们还进行了各种生化分析,以表征 B4GALNT3 产生的聚糖的结构,包括它们的“表位”——与其他分子相互作用的识别位点——然后研究了 LDN 对这些表位制造的影响。
他们发现,缺少 PA14 结构域的 B4GALNT3 突变版本与 N 连接和 O 连接聚糖以及糖蛋白相关的活性显著降低。这表明 PA14 结构域对于酶活性至关重要。
研究人员还能够更好地理解 LDN 和 LacNAc 之间的功能差异。他们发现,LDN 取代 LacNAc 会对许多糖基转移酶在 N-聚糖末端修饰或添加糖残基的作用产生负面影响。这些末端修饰(称为“N-聚糖封端”)在确定糖蛋白的结构、功能、稳定性和相互作用方面起着至关重要的作用。
“换句话说,LDN 对与典型的 LacNAc 结构完全不同的 N-聚糖的产生有显著影响,”Yasuhiko Kizuka 说。
研究人员现在希望深入研究 B4GALNT3 和 LDN 在疾病发病机制中的作用并确定潜在的治疗靶点。
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